Door oorlogshandelingen was de kerk beschadigd geraakt in 1943. Na de oorlog is het hersteld.
Zowel qua ex- als interieur is het een sobere interbellumkerk, zonder toren. Het is een relatief korte, brede eenbeukige kerk. Links naast het koor bevindt zich een stenen klokkenstoel met een klok.
Vanaf eind jaren 2000 was dit, tot nader order, het centrale kerkgebouw van de R.K. parochie Amsterdam-Noord.
Men was in eerste instantie van plan de St. Stephanuskerk met pastorie te slopen en te vervangen door een nieuw kerkelijk centrum. Uiteindelijk is de St. Stephanuskerk, inclusief de pastorie, van eind 2013 tot zomer 2014 gerestaureerd en het interieur gerenoveerd/gemoderniseerd. Zondag 27 juli 2014 is de vernieuwde kerk in gebruik genomen.
De handhaving van de St. Augustinuskerk als tweede kerk gaat niet door; hier vond zondag 24 augustus 2014 de laatste R.K. viering plaats; de kerk is verkocht voor de inrichting van een “Memorarium”.
In verband met dit alles heeft de St. Stephanuskerk sinds 27 juli 2014 de naam “De Nieuwe Augustinuskerk”, als nu enige kerk van de, al in 2004 door parochiefusies ontstane, R.K. parochie St. Augustinus van Amsterdam-Noord.